5 июня 1706 года в России появилось первое государственное лечебное учреждение - ныне Главный военный клинический орденов Ленина и Трудового Красного Знамени госпиталь имени академика Н. Н. Бурденко.
25 мая (5 июня) 1706 года в Лефортове по указу Петра Первого был основан госпиталь («Военная Гошпиталь»), который стал первым в России государственным лечебным учреждением.
В указе Петра I об основании госпиталя говорилось: «В прошлом 1706 г. Великий Государь и Великий князь Пётр Алексеевич всея Великия и Малыя, и Белыя России Самодержец указал по имянному своему Великого Государя указу построить за Яузою-рекою против Немецкой слободы в пристойном месте гошпиталь для лечения болящих людей».
Основателем госпиталя (и первой в России медицинской школы при нём) был Николай Бидлоо, голландский врач, который до этого был личным врачом Петра I: «А у того лечения быть доктору Николаю Бидлоо, да двум лекарям, Андрею Репкину, а другому - кто прислан будет».
Первых пациентов принял 21 ноября (2 декабря) 1707 года.
10 февраля 1797 года профессор патологии и медицинской практики госпиталя М. Х. Пеккен открыл в нём «постоянную клиническую палату» - первую терапевтическую клинику в России, в которой первоначально было только 10 кроватей.
Основное здание госпиталя, сохранившееся до наших дней, построено в 1798-1802 годах по проекту архитектора Ивана Еготова.
Во время Отечественной войны 1812 года он принял свыше 17 тысяч раненых и больных, в Первую мировую войну - около 400 тысяч. Во время Великой Отечественной войны госпиталь продолжал активную работу и назывался Московский коммунистический военный госпиталь № 393. За двести лет в госпитале пролечились почти 4 млн человек. В нём работали Склифосовский, Пирогов и другие известные российские врачи.
Госпиталь был не только лечебным учреждением, но и учебным: здесь появилась первая в России медицинская школа для подготовки лекарей, первый анатомический центр.
В 1946 госпиталю было присвоено имя академика Н. Н. Бурденко.
В 1968 году награждён орденом Трудового Красного Знамени, в 1982 году - орденом Ленина.
В 1991 году Госпиталь стал одним из учредителей ОАО НПФ «Перфторан», производящего кровезаменитель «Перфторан».
Ныне это одна из крупнейших больниц (1550 коек) в России. Ежегодно в госпитале лечатся около 22 тысяч раненых и больных, проводится свыше 9 тысяч операций. Здесь трудятся более 3 500 сотрудников, из них 800 - врачи.
На базе госпиталя функционирует 130 лечебно-диагностических отделений и лабораторий, 10 кафедр, интернатура. В госпитале работают более 70 докторов медицинских наук, 44 профессора, более 170 кандидатов медицинских наук.
Для экстренной эвакуации раненых из очагов военных действий госпиталь оснащён уникальной летающей операционно-реанимационной лабораторией «Скальпель», благодаря которой во время второй чеченской кампании сюда были доставлены более 3 тыс. раненых.
Имеет филиалы № 1 (Москва), № 3 (мкрн. Купавна, г. Балашиха, Московская область), № 5 (Москва), № 7 (г. Сергиев Посад, Московская область).
В разное время заведение имело различные названия: Московский госпиталь (1707), Московский генеральный сухопутный госпиталь (1756), Московский военный госпиталь (1801), Московский генеральный Императора Петра I военный госпиталь (1907), Первый Московский коммунистический военный госпиталь (1918), Главный военный госпиталь Красной Армии (1944), Главный военный госпиталь ВС СССР (1946), Главный военный клинический госпиталь имени академика Н. Н. Бурденко (1967), Главный военный клинический орденов Ленина и Трудового Красного Знамени госпиталь имени академика Н. Н. Бурденко (1982), Федеральное государственное бюджетное учреждение «Главный военный клинический госпиталь имени академика Н.Н.Бурденко» Министерства обороны Российской Федерации (ФГБУ «ГВКГ им. Н. Н. Бурденко»).